Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC2Q9Y235 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms