Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW0

TPX2, Targeting protein for Xklp2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPX2Q9ULW0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPX2Q9ULW0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPX2Q9ULW0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPX2Q9ULW0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPX2Q9ULW0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPX2Q9ULW0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPX2Q9ULW0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TPX2Q9ULW0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TPX2Q9ULW0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPX2Q9ULW0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPX2Q9ULW0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPX2Q9ULW0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPX2Q9ULW0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPX2Q9ULW0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms