Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CGGBP1Q9UFW8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CGGBP1Q9UFW8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 534.9 ms