Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTI1BQ9UEU0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VTI1BQ9UEU0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTI1BQ9UEU0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms