Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPG2Q9UBF2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPG2Q9UBF2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPG2Q9UBF2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms