Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC3Q9NYG2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC3Q9NYG2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC3Q9NYG2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms