Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY87

SPANXC, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXCQ9NY87 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPANXCQ9NY87 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPANXCQ9NY87 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPANXCQ9NY87 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPANXCQ9NY87 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPANXCQ9NY87 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPANXCQ9NY87 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPANXCQ9NY87 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPANXCQ9NY87 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPANXCQ9NY87 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPANXCQ9NY87 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPANXCQ9NY87 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPANXCQ9NY87 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPANXCQ9NY87 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPANXCQ9NY87 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPANXCQ9NY87 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPANXCQ9NY87 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPANXCQ9NY87 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPANXCQ9NY87 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPANXCQ9NY87 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPANXCQ9NY87 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms