Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZCCHC17Q9NP64 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ZCCHC17Q9NP64 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms