Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSS3Q9H6R3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACSS3Q9H6R3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSS3Q9H6R3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms