Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHACTR1Q9C0D0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHACTR1Q9C0D0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms