Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC2P3Q9BVR0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HERC2P3Q9BVR0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms