Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNPPD1Q9BV87 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms