Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP6Q9BRS8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LARP6Q9BRS8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP6Q9BRS8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms