Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RETNLBQ9BQ08 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms