Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3CQ99985 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3CQ99985 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms