Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GL1Q99961 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3GL1Q99961 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3GL1Q99961 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms