Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN2Q99700 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN2Q99700 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN2Q99700 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms