Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2E2Q96LR5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2E2Q96LR5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms