Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAPNS2Q96L46 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPNS2Q96L46 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms