Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
COG3Q96JB2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
COG3Q96JB2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
COG3Q96JB2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.4 ms