Protein–RNA interactions for Protein: Q96HC4

PDLIM5, PDZ and LIM domain protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM5Q96HC4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM5Q96HC4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms