Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C12orf43Q96C57 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf43Q96C57 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf43Q96C57 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms