Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINC00301Q8NCQ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LINC00301Q8NCQ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC00301Q8NCQ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms