Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00612Q8N6U2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00612Q8N6U2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms