Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPAS3Q8IXF0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPAS3Q8IXF0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms