Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TREML1Q86YW5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREML1Q86YW5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREML1Q86YW5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms