Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SKAP1Q86WV1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SKAP1Q86WV1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms