Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L2

R3HCC1L, Coiled-coil domain-containing protein R3HCC1L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1LQ7Z5L2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1LQ7Z5L2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms