Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNI2Q6ZMN8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms