Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPTNQ6XPR3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPTNQ6XPR3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPTNQ6XPR3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms