Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD4L3Q6VB84 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD4L3Q6VB84 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms