Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOBEC3HQ6NTF7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms