Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA3Q6AZY7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARA3Q6AZY7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARA3Q6AZY7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms