Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LYSMD4Q5XG99 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYSMD4Q5XG99 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms