Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
WASHC2DQ5SRD0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC2DQ5SRD0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms