Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP47Q5SQN1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP47Q5SQN1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP47Q5SQN1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms