Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRFIP1Q32MZ4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRFIP1Q32MZ4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRFIP1Q32MZ4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms