Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AP5B1Q2VPB7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP5B1Q2VPB7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP5B1Q2VPB7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms