Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KLHL40Q2TBA0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KLHL40Q2TBA0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL40Q2TBA0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms