Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ME3Q16798 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ME3Q16798 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ME3Q16798 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ME3Q16798 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ME3Q16798 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ME3Q16798 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ME3Q16798 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ME3Q16798 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ME3Q16798 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ME3Q16798 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ME3Q16798 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ME3Q16798 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ME3Q16798 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ME3Q16798 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ME3Q16798 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ME3Q16798 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ME3Q16798 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ME3Q16798 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ME3Q16798 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ME3Q16798 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ME3Q16798 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ME3Q16798 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ME3Q16798 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ME3Q16798 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ME3Q16798 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ME3Q16798 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ME3Q16798 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ME3Q16798 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ME3Q16798 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ME3Q16798 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ME3Q16798 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ME3Q16798 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ME3Q16798 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ME3Q16798 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ME3Q16798 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ME3Q16798 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ME3Q16798 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ME3Q16798 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ME3Q16798 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ME3Q16798 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ME3Q16798 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ME3Q16798 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ME3Q16798 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ME3Q16798 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ME3Q16798 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ME3Q16798 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ME3Q16798 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ME3Q16798 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ME3Q16798 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ME3Q16798 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ME3Q16798 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ME3Q16798 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ME3Q16798 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ME3Q16798 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ME3Q16798 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ME3Q16798 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ME3Q16798 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ME3Q16798 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ME3Q16798 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ME3Q16798 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ME3Q16798 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ME3Q16798 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ME3Q16798 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ME3Q16798 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ME3Q16798 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ME3Q16798 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ME3Q16798 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ME3Q16798 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ME3Q16798 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ME3Q16798 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ME3Q16798 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ME3Q16798 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ME3Q16798 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ME3Q16798 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ME3Q16798 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ME3Q16798 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ME3Q16798 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ME3Q16798 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ME3Q16798 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ME3Q16798 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ME3Q16798 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ME3Q16798 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ME3Q16798 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ME3Q16798 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ME3Q16798 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ME3Q16798 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ME3Q16798 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ME3Q16798 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ME3Q16798 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ME3Q16798 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME3Q16798 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME3Q16798 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME3Q16798 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME3Q16798 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME3Q16798 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME3Q16798 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME3Q16798 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ME3Q16798 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ME3Q16798 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
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