Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX2Q16385 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX2Q16385 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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