Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LAPTM4AQ15012 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAPTM4AQ15012 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAPTM4AQ15012 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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