Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC10A1Q14973 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A1Q14973 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A1Q14973 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A1Q14973 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A1Q14973 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A1Q14973 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A1Q14973 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A1Q14973 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A1Q14973 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC10A1Q14973 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC10A1Q14973 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC10A1Q14973 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms