Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL1Q13616 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL1Q13616 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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