Protein–RNA interactions for Protein: Q13489

BIRC3, Baculoviral IAP repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIRC3Q13489 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIRC3Q13489 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BIRC3Q13489 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIRC3Q13489 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIRC3Q13489 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIRC3Q13489 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIRC3Q13489 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BIRC3Q13489 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BIRC3Q13489 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BIRC3Q13489 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIRC3Q13489 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIRC3Q13489 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIRC3Q13489 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BIRC3Q13489 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BIRC3Q13489 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIRC3Q13489 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIRC3Q13489 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIRC3Q13489 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIRC3Q13489 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIRC3Q13489 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms