Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 LSG1YGL099W 1923 nt6.14□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 RPN5YDL147W 1338 nt6.14□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 HOF1YMR032W 2010 nt6.14□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 TUL1YKL034W 2277 nt6.14□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 HSX1tR(CCU)J 72 nt6.13□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 APS3YJL024C 585 nt6.13□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 TEP1YNL128W 1305 nt6.13□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 SKN1YGR143W 2316 nt6.13□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 VPS70YJR126C 2436 nt6.13□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.12□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 SLO1YER180C-A 258 nt6.12□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 SKI6YGR195W 741 nt6.12□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 CTR2YHR175W 570 nt6.12□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 PRP46YPL151C 1356 nt6.12□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 PMA1YGL008C 2757 nt6.12□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 FRE7YOL152W 1863 nt6.11□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 RPS16BYDL083C 432 nt6.11□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 PRO3YER023W 861 nt6.11□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 RRT7YLL030C 342 nt6.11□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 PIN2YOR104W 849 nt6.11□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 SFB3YHR098C 2790 nt6.11□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 LCB2YDR062W 1686 nt6.1□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 ATG1YGL180W 2694 nt6.1□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 RPT6YGL048C 1218 nt6.1□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 LYS12YIL094C 1116 nt6.1□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 PML1YLR016C 615 nt6.1□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 MID2YLR332W 1131 nt6.1□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 YNR048WYNR048W 1182 nt6.1□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 VMA4YOR332W 702 nt6.1□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 NDC1YML031W 1968 nt6.09□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 COX26YDR119W-A 201 nt6.09□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt6.09□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 YGR291CYGR291C 222 nt6.09□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 YNR040WYNR040W 771 nt6.09□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 RPN7YPR108W 1290 nt6.09□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt6.09□□□□□ -1.43
RTP1Q12751 RPT1YKL145W 1404 nt6.08□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 GIP1YBR045C 1920 nt6.08□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt6.08□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 RSM10YDR041W 612 nt6.08□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 CAD1YDR423C 1230 nt6.08□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 URA3YEL021W 804 nt6.08□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 YOR318CYOR318C 306 nt6.08□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 CSG2YBR036C 1233 nt6.08□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 SAM4YPL273W 978 nt6.08□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 STE12YHR084W 2067 nt6.08□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 CRZ1YNL027W 2037 nt6.08□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 VTH1YIL173W 4650 nt6.07□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 VTH2YJL222W 4650 nt6.07□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 YMD8YML038C 1329 nt6.07□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 OCA1YNL099C 717 nt6.07□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 IFA38YBR159W 1044 nt6.07□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 PMT2YAL023C 2280 nt6.07□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 HSP104YLL026W 2727 nt6.07□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 EPS1YIL005W 2106 nt6.07□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 TNA1YGR260W 1605 nt6.07□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 GAS3YMR215W 1575 nt6.06□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 PYC1YGL062W 3537 nt6.06□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 NPA3YJR072C 1158 nt6.06□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 RSA3YLR221C 663 nt6.06□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 YNL296WYNL296W 315 nt6.06□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt6.06□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 ENV9YOR246C 993 nt6.06□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 DBF2YGR092W 1719 nt6.05□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 YME1YPR024W 2244 nt6.05□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 MMR1YLR190W 1476 nt6.05□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 RAM1YDL090C 1296 nt6.05□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 GET3YDL100C 1065 nt6.05□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 YER010CYER010C 705 nt6.05□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 HAP2YGL237C 798 nt6.05□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 ATP14YLR295C 375 nt6.05□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 MAC1YMR021C 1254 nt6.05□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 GUA1YMR217W 1578 nt6.05□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 MRE11YMR224C 2079 nt6.05□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 MKK2YPL140C 1521 nt6.04□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 SIR2YDL042C 1689 nt6.04□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 STE13YOR219C 2796 nt6.04□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 MMP1YLL061W 1752 nt6.04□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 SUP2tY(GUA)D 75 nt6.04□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 SUP11tY(GUA)F1 75 nt6.04□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 SUP6tY(GUA)F2 75 nt6.04□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 SUP7tY(GUA)J1 75 nt6.04□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 SUP4tY(GUA)J2 75 nt6.04□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 SUP5tY(GUA)M1 75 nt6.04□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 SUP8tY(GUA)M2 75 nt6.04□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 SUP3tY(GUA)O 75 nt6.04□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 YLL059CYLL059C 507 nt6.04□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 HCR1YLR192C 798 nt6.04□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 CKA2YOR061W 1020 nt6.04□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 YOR342CYOR342C 960 nt6.04□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 COS9YKL219W 1224 nt6.03□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 YOL131WYOL131W 327 nt6.03□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 MCM6YGL201C 3054 nt6.03□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 FAA4YMR246W 2085 nt6.03□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 SLD2YKL108W 1362 nt6.03□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 ATR1YML116W 1629 nt6.03□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 GCR2YNL199C 1605 nt6.03□□□□□ -1.44
RTP1Q12751 PSY4YBL046W 1326 nt6.02□□□□□ -1.45
RTP1Q12751 PHA2YNL316C 1005 nt6.02□□□□□ -1.45
RTP1Q12751 SUE1YPR151C 621 nt6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.3 ms