Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TFF3Q07654 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.4 ms