Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5Q00535 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK5Q00535 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms