Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB1P62873 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB1P62873 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB1P62873 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB1P62873 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB1P62873 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB1P62873 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB1P62873 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB1P62873 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB1P62873 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB1P62873 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB1P62873 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB1P62873 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB1P62873 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB1P62873 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GNB1P62873 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GNB1P62873 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB1P62873 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB1P62873 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB1P62873 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB1P62873 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB1P62873 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB1P62873 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB1P62873 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB1P62873 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB1P62873 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB1P62873 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB1P62873 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB1P62873 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB1P62873 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB1P62873 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB1P62873 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB1P62873 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB1P62873 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB1P62873 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB1P62873 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB1P62873 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB1P62873 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB1P62873 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB1P62873 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB1P62873 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB1P62873 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB1P62873 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB1P62873 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB1P62873 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB1P62873 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB1P62873 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB1P62873 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB1P62873 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB1P62873 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB1P62873 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB1P62873 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB1P62873 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB1P62873 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB1P62873 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB1P62873 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB1P62873 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB1P62873 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB1P62873 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB1P62873 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB1P62873 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB1P62873 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB1P62873 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB1P62873 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB1P62873 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB1P62873 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB1P62873 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB1P62873 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB1P62873 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB1P62873 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB1P62873 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB1P62873 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB1P62873 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB1P62873 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB1P62873 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB1P62873 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB1P62873 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB1P62873 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB1P62873 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB1P62873 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB1P62873 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB1P62873 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB1P62873 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB1P62873 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB1P62873 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB1P62873 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB1P62873 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB1P62873 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GNB1P62873 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GNB1P62873 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GNB1P62873 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GNB1P62873 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB1P62873 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB1P62873 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB1P62873 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB1P62873 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB1P62873 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB1P62873 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB1P62873 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB1P62873 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms