Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPEP62304 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPEP62304 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms